华雅思创生物推出一波分子产品,电泳是分子最基础的实验,今天华雅思创先和大家聊聊如何得到一张漂亮的电泳图。
做一块优质的琼脂糖凝胶
“工欲善其事,必先利其器”,能否做一块好的琼脂糖凝胶,直接影响到后面电泳和结果的分析。制胶前,给大家的建议:
1. 在制胶时必须将制胶模具、梳子以及烧杯等物品洗净,以免干胶及其他杂质带入;
2. 在溶胶时应观察溶液中是否有未溶解的琼脂糖颗粒,确保溶胶完全;
3. 在溶液倒入制胶模具前必须充分混匀,以免制出来的胶出现不均匀的现象。
图一:制胶时带入了其它杂质,形成了障碍物,使得DNA条带电泳时受到阻碍无法继续电泳,从而形成扭曲带
图二:制胶时溶胶不完全以致琼脂糖颗粒残留,形成一些浓度较高的凝胶区域,在DNA电泳经过这些区域时,部分DNA被阻碍在这里而形成不规则亮带。
合适浓度的琼脂糖凝胶
凝胶的浓度是常被忽略问题。建议:长片段的DNA选用低浓度的凝胶电泳,短片段的DNA则选用高浓度的凝胶电泳。
表一:分离不同大小的DNA片段所用的最适凝胶浓度
合适的核酸上样量电泳
要想电泳跑出可见条带的话,至少需要上样50 ng,但是0.5 cm宽的梳子最好不超过0.5μg的DNA量,因为上样量过多会造成加样孔超载,从而导致拖尾或弥散,对于较长的DNA此现象更为明显。另外,加样量的多少还应依据加样孔的大小及DNA片段的长度而定,当加样孔大时,样品上样量应相应加大。
合适的电压电泳
通常情况下电压越低,走出的电泳条带越平整。低电压电泳时,电泳缓冲液也不容易发烫,也能确保在电泳的过程中凝胶不会变形。当然电压太低,等待电泳结果的时间就会延长,综合考虑,一般控制电泳电压≤5V/cm,即可保证电泳条带的清晰度。
图三和图四同一样本跑出的图,但是出来的效果差别非常大,主要是因为电泳时的电压不同
图三由于电泳的电压过大,导致电泳条带都扭曲变形了。
合适的电泳距离(控制电泳时间)
一些片段的DNA,电泳20-30min家常便饭,有的甚至需要更长的时间,如果想稍微快一点,可以选用浓度比较稀的凝胶或稍微调高一点电压进行电泳。
众所周知,Lonza是世界上久负盛名的琼脂糖源生产商,其所产琼脂糖质量上乘、畅销全球,深受工业生产和科研用户的欢迎。选择正确的琼脂糖就等于配了一把保险锁,帮助您把实验误差降至,实验结果更漂亮,更重要的是降低您的实验成本!
SeaKem® Gold Agarose是一种高凝胶强度,低EEO(电渗),标准凝胶温度的琼脂糖。SeaKem® Gold Agarose琼脂糖属于遗传技术级别, 适用于在脉冲场凝胶电泳实验(PFGE)中快速分离巨大碱基对DNA。低电渗性能使得其在凝胶电泳实验中DNA电泳迁移率明显大于使用传统琼脂糖,调节缓冲液和琼脂糖浓度可以使跑胶时间减少一半。高凝胶强度使其在低浓度时很容易操作,能够使用传统电泳分离大DNA片段,减少分离 DNA片段时间(PFGE)。
产品名称:SeaKem® Gold琼脂糖粉
产品货号:50150
性能
• 高凝胶强度;
• 低EEO(电渗)≤0.05
• 脉冲场凝胶电泳中可分离DNA 50kb-10Mb
• 垂直电泳中可快速分离DNA 30kb-50kb
关于这些参数的内涵:
1. 凝胶强度:衡量琼脂糖性能的关键参数,凝胶强度越高,凝胶性能越好,可以保证在低浓度下,凝胶性能依然很好,高凝胶强度琼脂糖适合大分子核酸。Seakem Gold Agarose 凝胶强度高,可在0.3%、0.5%的浓度下分离超大片段核酸。
2. 低电渗(Low EEO):电渗是一种物理现象,由于琼脂糖这样的多孔支持物在电场中会吸附水中的正负离子,而使溶液带电向电极泳动,从而干扰核酸或蛋白电泳, Lonza Seakem Gold Agarose金琼脂糖是低电渗≤0.05,几乎不干扰核酸电泳。
• 分析长片段 PCR 产物
• 分离和进一步操作 DNA >1,000 bp
• DNA & RNA 的分析电泳
• DNA & RNA 印迹
产品信息
品牌 | 产品货号 | 产品名称 |
Lonza | 50150 | SeaKem® Gold琼脂糖粉 |
Lonza | 50100 | SeaPlaque AGAROSE琼脂糖125G |
Lonza | 50110 | SeaPlaque GTG AGAROSE琼脂糖125G |
QIAGEN | 52904 | Viral RNA Mini Kit 病毒RNA提取试剂盒 |
QIAGEN | 762164 | PAXgene Blood RNA Kit |
QIAGEN | 762174 | PAXgene Blood RNA Kit (50) |
Thermo | KIT0204 /KIT0214 | PicoPure™ RNA Isolation Kit |
Thermo | 15596026/15596018 | TRIZOL RNA提取试剂 |
Bio-Rad | TLS0851 | 0.2ml低位8联薄壁PCR管,无盖, |
Bio-Rad | TLS0803 | 0.2ml低位9联薄壁PCR管盖,透明光学级平顶 |
BD | 762165 | PAXgene Blood RNA Tube RNA样本收集管 |
BD | 364606 | 8.5mL ACD全血玻璃管,A型ACD溶液, |
BD | 362788 | 5mL BD血浆准备管(PPT管) |
BD | 362799 | 8.5mL BD血浆准备管(PPT管) |
BD | 365967 | 0.5mL 末梢采血管;金黄色头盖 |
BD | 365978 | 0.5mL 末梢采血管;金黄色头盖 |
BD | 365963 | 0.5mL 末梢采血管;红色头盖 |
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