Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX WGA Kit单细胞全基因组扩增试剂盒
华雅思创生物现货供应
【产品优势】
1.可再生的单个细胞的结果(或< 15 pg DNA)
2.优越的再现性等位基因的表示
3.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒易于使用和自动化
4.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒在所有分辨率、微阵列和PCR上都有明确的结果
【产品应用】
研究领域
PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒的适用范围十分广泛,多种原始材料和微量样品均可通过该试剂盒进行单细胞全基因组扩增,
•生物标志物研究(CNVs、SNVs)
•体外受精胚胎植入前基因测序
•转基因动物基因分型
•胚胎和干细胞研究
•单精子分型 肿瘤
•体细胞遗传变异分析
•肿瘤进化和发展
•肿瘤干细胞
•循环肿瘤细胞 细菌
•宏基因组学研究
•微生物基因分型
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒可实现高度均一的全基因组扩增,其核心技术为多次退火环状循环扩增(MALBAC)技术,该技术利用独特的具有链置换活性的DNA聚合酶进行准线性的全基因组预扩增,通过PCR进行指数式扩增,为下游分析提供充分的实验材料。
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒解决了单细胞全基因组扩增的其中几个必要的矛盾:
1. 线性扩增。如果用全基因组PCR扩增,因为PCR的扩增偏向性,再加上PCR过程中较小的偏向性通过指数放大,其结果就会是严重的覆盖不均一,导致在许多地方只有很低的覆盖、甚至没有覆盖。所以,保证模板被线性地扩增,是首要问题。
2. 全基因组覆盖。常规的建库方法,因为补平、加A、接头连接效率的问题,起始DNA中有很大一部分会被浪费,没有形成有效文库分子(也就是两头都接好引物的DNA片段)。在单细胞测序中,这是不可接受的。
3. 高扩增效率。单细胞中的每个基因位置理论上都只有2个拷贝,而要从2个拷贝扩增到足够建立文库的DNA量,要经过许多次的扩增。这就需要很高的扩增效率。而一般的线性扩增很难有好的扩增效率
我们的PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒与MALBAC其技术原理一样,
MALBAC™技术(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles),即多次退火环状循环扩增技术,为一种单细胞全基因组扩增技术,先利用独特的具有链置换活性的DNA聚合酶进行准线性的全基因组预扩增,再通过PCR技术进行指数式扩增,为下游分析提供充足的实验材料。
MALBAC™技术源于哈佛大学,其专利全球唯一指定授权给亿康基因,是目前世界上最先进的单细胞全基因组扩增技术,使用该技术的相关论文发表于顶级科学期刊《Cell》、《Science》、《PNAS》等。使用该技术,科学家们完成了迄今覆盖度最高的单精子基因图谱,首次对人类单个卵细胞完成了测序。Science杂志评选单细胞测序技术为2013年最具发展前景的六大科学项目之一,Nature Methods也将其选为Method of the Year 2013。
MALBAC技术优势:
1) MALBAC技术降低PCR扩增偏倚,使得单细胞中最大90%以上的基因组能够被测序。
2) MALBAC技术使得检测单细胞中较小的DNA序列变异变得更容易,因此能够发现个别细胞之间的遗传差异。这样的差异可以帮助解释癌症恶化的机制,生殖细胞形成机制,甚至是个别神经元的差异机制。
3) 灵敏度高:单细胞、单染色体或0.5pg的基因组DNA即可进行扩增。
4) MALBAC技术扩增均匀性显著优于其它同类技术,低覆盖度测序数据即可进行CNV分析,用于染色体三体检测及染色体微缺失变异检测。
5) 扩增产物用途广泛:可用于二代测序、微阵列、qPCR、基因克隆等下游应用。
MALBAC™引领学术突破性进展:
1.在国际顶尖杂志发表文章:Science 、Cell 、PNAS、Annual Review等
2.严格验证MALBAC技术用于PGS的文章发表于ASRM(美国生殖医学学会)会刊
3.首次完成人类单个卵细胞的测序
4.完成迄今覆盖度最高的单精子基因图谱
5.全球首个无创植入前染色体筛查宝宝诞生,相关成果发表于《PNAS》
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒其原理:
PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒通过扩增产物的末端自封闭来抑制指数扩增。 •
PicoPLEX® WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒通过数轮线性扩增得到大量的扩增产物
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美国Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn 现货供应
【研究领域】
1. 外显子组富集
2. SureSelect® 富集
3. SeqCap® EZ 富集
4. 福尔马林固定石蜡包埋DNA测序
5. 胚胎植入前遗传学筛查(PGS)/种植前遗传学诊断(PGD)
6. DNA测序
7. RNA测序
8. 染色体免疫共沉淀测序
产品名称 |
平台 |
应用程序 |
样本 |
样本量 |
技术 |
ThruPLEX®DNA-seq Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向测序, 染色体免疫共沉淀测序, 转录组测序 |
FFPE DNA, gDNA, cDNA, |
50 pg – 50 ng |
高灵敏度基于连接的扩增 |
ThruPLEX®-FD Prep Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向测序,ctDNA分析 |
Cell-free DNA isolated from plasma |
<1 ng – 30 ng |
高灵敏度基于连接的扩增 |
PicoPLEX™ |
Illumina NGS |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60pg |
准随机引物线性扩增 |
PicoPLEX™ |
阵列, |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60 pg DNA |
准随机引物线性扩增 |
TransPLEX®C-WTA Kit |
阵列, |
基因表达分析 |
RNA |
10 – 300 ng RNA |
准随机引物扩增 |